Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
OtofQ9ESF1 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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OtofQ9ESF1 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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OtofQ9ESF1 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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OtofQ9ESF1 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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