Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC134917.3-201ENSMUST00000222057 1283 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm28250-201ENSMUST00000187025 2168 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm37157-201ENSMUST00000192120 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm37112-201ENSMUST00000194389 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Dubr-205ENSMUST00000191079 2105 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 L3mbtl2-204ENSMUST00000172748 3368 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ube3bQ9ES34 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Vmn2r-ps41-201ENSMUST00000173587 980 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube3bQ9ES34 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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