Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm27651-201ENSMUST00000183465 246 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Scgb1b12-201ENSMUST00000188355 417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Snora61-201ENSMUST00000083015 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Ccdc83-201ENSMUST00000040413 1546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm10224-201ENSMUST00000119496 615 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm11605-201ENSMUST00000120413 646 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm20447-201ENSMUST00000173290 599 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm19102-201ENSMUST00000201133 553 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trappc2Q9CQP2 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms