Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Saal1-201ENSMUST00000143082 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Cdh16-201ENSMUST00000163783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp47Q8BY87 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms