Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Ndst2-205ENSMUST00000225000 3661 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AI182371-206ENSMUST00000226631 1680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AC121860.1-201ENSMUST00000227908 2787 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Shq1Q7TMX5 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Shq1Q7TMX5 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms