Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltcQ68FD5 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltcQ68FD5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
CltcQ68FD5 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Arhgap6-205ENSMUST00000112131 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltcQ68FD5 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.6 ms