Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Obp2b-201ENSMUST00000114192 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29585-202ENSMUST00000187855 425 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC154314.1-201ENSMUST00000223995 2996 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm10024-201ENSMUST00000075421 553 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Xndc1-202ENSMUST00000106950 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Bgn-201ENSMUST00000033741 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC122402.1-201ENSMUST00000225199 2303 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 BC018473-201ENSMUST00000132056 1331 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Cdh5-201ENSMUST00000034339 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Efcab3-201ENSMUST00000021029 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 G3bp2-201ENSMUST00000113127 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Fanca-201ENSMUST00000035495 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Sytl4-201ENSMUST00000033608 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm15728-201ENSMUST00000140833 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm11875-201ENSMUST00000118187 799 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 CT025603.3-201ENSMUST00000224031 419 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Olfr1045-201ENSMUST00000099904 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Nat10-201ENSMUST00000028608 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Rasgrp1-205ENSMUST00000173541 2283 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gsta3-201ENSMUST00000027067 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Tro-207ENSMUST00000163969 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm20518-201ENSMUST00000150068 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Clcn1Q64347 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms