Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 AC122402.1-201ENSMUST00000225199 2303 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 C2cd5-207ENSMUST00000203673 3332 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Acsbg2-201ENSMUST00000043062 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Dpp6-202ENSMUST00000101471 4491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Clmn-202ENSMUST00000109937 3529 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Chrdl2-201ENSMUST00000032977 1520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Psen1-202ENSMUST00000101225 3023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm26672-202ENSMUST00000180931 3602 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Treml4Q3LRV9 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Treml4Q3LRV9 Gm40117-201ENSMUST00000198827 369 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Treml4Q3LRV9 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Treml4Q3LRV9 Olfr559-201ENSMUST00000084816 1022 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Lekr1-201ENSMUST00000099075 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Phactr4-201ENSMUST00000084170 4483 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Treml4Q3LRV9 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Duxbl3-202ENSMUST00000112340 2248 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Duxbl2-202ENSMUST00000172038 2248 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Uspl1-204ENSMUST00000119685 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 CT030170.4-201ENSMUST00000221539 1538 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Zfp949-204ENSMUST00000162827 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Galnt7-201ENSMUST00000034021 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Treml4Q3LRV9 Gm38272-201ENSMUST00000194431 2400 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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