Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Trim36-201ENSMUST00000037011 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm14336-201ENSMUST00000117491 475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Vmn1r-ps113-201ENSMUST00000121318 1106 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Mfap5-203ENSMUST00000121656 579 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Snhg12-206ENSMUST00000153474 606 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm3235-201ENSMUST00000168442 695 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm35067-201ENSMUST00000194355 647 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm45834-201ENSMUST00000212445 454 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Tas2r138-201ENSMUST00000076565 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Polr1b-202ENSMUST00000103205 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Hdlbp-201ENSMUST00000042498 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Tmem87a-202ENSMUST00000090046 2897 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Naa20-204ENSMUST00000134759 1883 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Slc30a6-202ENSMUST00000179074 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm28898-201ENSMUST00000189604 2167 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm37818-201ENSMUST00000194952 3169 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm10118-201ENSMUST00000079279 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm37443-201ENSMUST00000193458 2827 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm15728-201ENSMUST00000140833 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm42944-201ENSMUST00000198383 3980 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm22471-201ENSMUST00000104116 130 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm14967-201ENSMUST00000153483 335 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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LtbrP50284 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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LtbrP50284 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm46197-201ENSMUST00000217530 416 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Spink4-201ENSMUST00000030122 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Asph-206ENSMUST00000103004 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Adtrp-201ENSMUST00000072012 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm10101-202ENSMUST00000181311 2919 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Hmgcs2-201ENSMUST00000090746 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Dst-205ENSMUST00000182314 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Hacl1-201ENSMUST00000022437 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Tango2-201ENSMUST00000115628 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Slc25a30-201ENSMUST00000022580 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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