Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ifna4-201ENSMUST00000094973 561 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm5431-201ENSMUST00000109209 1701 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Kif5a-202ENSMUST00000217895 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms