Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5388-201ENSMUST00000120059 1117 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9974-201ENSMUST00000120357 693 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11209-201ENSMUST00000130206 431 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13405-201ENSMUST00000146769 708 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12305-201ENSMUST00000151817 407 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Slc15a2-205ENSMUST00000164579 1068 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Guk1-205ENSMUST00000170895 743 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Nip7-202ENSMUST00000170962 606 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20918-201ENSMUST00000179629 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Asb4-202ENSMUST00000183358 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29142-201ENSMUST00000188009 696 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28508-201ENSMUST00000188016 696 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37155-201ENSMUST00000192152 406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm19196-202ENSMUST00000210709 321 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm19196-203ENSMUST00000211164 363 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm19005-201ENSMUST00000218890 865 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Taf1b-203ENSMUST00000222710 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC137117.2-201ENSMUST00000228560 282 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ccl17-201ENSMUST00000034232 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Prp2-201ENSMUST00000076061 1074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm22422-201ENSMUST00000083060 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Stx8-203ENSMUST00000108675 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gpcpd1-201ENSMUST00000028822 3179 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Pramef17-201ENSMUST00000105762 1753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms