Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm12917-201ENSMUST00000119850 639 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm11999-201ENSMUST00000145789 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Slc35a5-205ENSMUST00000181177 865 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm20936-201ENSMUST00000191049 658 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm42654-201ENSMUST00000200789 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 CT025603.3-201ENSMUST00000224031 419 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gatad2b-201ENSMUST00000049382 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm16239-201ENSMUST00000160182 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 BC018473-201ENSMUST00000132056 1331 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Prune2-207ENSMUST00000225351 2115 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Hrh4-201ENSMUST00000041676 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm14273-201ENSMUST00000136315 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Tsnaxip1-203ENSMUST00000212566 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gria2-202ENSMUST00000107745 4026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Slc15a5-206ENSMUST00000171804 2461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 A230009B12Rik-201ENSMUST00000159422 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Gm2035J3QP87 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms