Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rnft1Q9DCN7 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms