Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprtQ99M80 Nsun3-201ENSMUST00000063089 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Scn3b-206ENSMUST00000176185 4090 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Esrrb-204ENSMUST00000116402 4300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Zfp961-201ENSMUST00000109997 2713 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm12983-201ENSMUST00000120974 310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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