Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Usp54Q8BL06 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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