Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm6465-201ENSMUST00000168154 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms