Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprkP35822 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprkP35822 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprkP35822 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms