Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14094-201ENSMUST00000117717 610 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm9050-201ENSMUST00000119501 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14141-201ENSMUST00000120236 783 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12989-201ENSMUST00000122331 731 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dlx1as-203ENSMUST00000140271 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 D630023F18Rik-202ENSMUST00000148020 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8596-201ENSMUST00000188004 792 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rps3-205ENSMUST00000208532 489 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45834-201ENSMUST00000212445 454 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps91-201ENSMUST00000213039 784 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Trim39-201ENSMUST00000042717 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8138-201ENSMUST00000169473 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8165-201ENSMUST00000095981 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm23382-201ENSMUST00000157678 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm6410-201ENSMUST00000181337 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms