Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mir501-201ENSMUST00000102296 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12987-201ENSMUST00000118562 489 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12037-201ENSMUST00000123160 308 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2210408F21Rik-205ENSMUST00000138606 482 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13645-201ENSMUST00000145163 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sectm1b-207ENSMUST00000170381 1011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm3654-201ENSMUST00000173038 909 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rps10-208ENSMUST00000178774 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm4651-201ENSMUST00000181738 1283 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm27403-201ENSMUST00000184662 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45238-201ENSMUST00000210204 517 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm39132-201ENSMUST00000210446 429 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm6593-201ENSMUST00000211165 1135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm31698-201ENSMUST00000214227 430 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC154598.2-201ENSMUST00000227114 604 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rpl36-ps3-201ENSMUST00000085720 315 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC147250.1-201ENSMUST00000224781 1364 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC154207.1-201ENSMUST00000221924 1483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 583.6 ms