Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12391-201ENSMUST00000117626 282 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Taar7c-ps-201ENSMUST00000122123 1055 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm11999-201ENSMUST00000145789 813 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Mir3093-201ENSMUST00000175247 87 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm34106-201ENSMUST00000193782 503 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm26930-201ENSMUST00000194874 1244 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm34322-201ENSMUST00000214224 719 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm33053-201ENSMUST00000215275 1144 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm10272-201ENSMUST00000092371 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Fuom-202ENSMUST00000120034 680 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm11534-202ENSMUST00000129261 470 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Smim18J3QNP2 Gm27406-201ENSMUST00000184881 182 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms