Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm35392-201ENSMUST00000209934 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Rorb-203ENSMUST00000112832 9293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Fam229b-206ENSMUST00000136546 592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm44986-201ENSMUST00000206292 2829 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Anpep-202ENSMUST00000107392 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ScaperF8VQ70 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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