Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Kin-201ENSMUST00000042512 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Atf7-203ENSMUST00000169033 2165 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm43465-201ENSMUST00000200367 2802 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC139381.1-201ENSMUST00000224215 478 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gnpda2-206ENSMUST00000166298 1755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Xntrpc-202ENSMUST00000094129 4150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4931431C16Rik-201ENSMUST00000124643 2735 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Acbd5-202ENSMUST00000114523 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Usp9yF8VPU6 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rnf19a-203ENSMUST00000228358 3452 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Bank1-203ENSMUST00000196159 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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