Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ikbke-201ENSMUST00000062108 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Clasp2-202ENSMUST00000163895 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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