Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Kcnip4-206ENSMUST00000175660 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rnf41-202ENSMUST00000171342 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Baalc-201ENSMUST00000163313 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm37521-201ENSMUST00000193177 2045 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Dync1i2-206ENSMUST00000112140 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ehmt1-201ENSMUST00000046227 4554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rtel1-204ENSMUST00000108814 4322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rgs9-204ENSMUST00000106706 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gprc5d-201ENSMUST00000032327 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ncaph2-202ENSMUST00000074552 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Nim1k-201ENSMUST00000178142 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cenpu-201ENSMUST00000034045 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Rnf185-202ENSMUST00000077078 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tigit-201ENSMUST00000096065 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tmprss11d-201ENSMUST00000031175 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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