Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2f2-201ENSMUST00000088922 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tollip-203ENSMUST00000130439 1892 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5535-201ENSMUST00000099292 1743 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700084J12Rik-202ENSMUST00000187707 1992 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv3-11-201ENSMUST00000197500 385 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43442-201ENSMUST00000202865 414 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1190028D05Rik-201ENSMUST00000210977 763 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3953-201ENSMUST00000213963 789 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tigit-201ENSMUST00000096065 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sncaip-210ENSMUST00000179689 1512 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ugt1a9-201ENSMUST00000073772 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11977-201ENSMUST00000118511 1461 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14044-201ENSMUST00000117531 447 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5388-201ENSMUST00000120059 1117 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rps9-205ENSMUST00000126562 896 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg7os-201ENSMUST00000126798 546 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms