Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Siah1bQ06985 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Siah1bQ06985 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Stag1-201ENSMUST00000041418 5909 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Siah1bQ06985 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms