Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Rpl9-ps2-201ENSMUST00000120821 577 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SrprbP47758 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms