Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm378-201ENSMUST00000120797 820 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12864-201ENSMUST00000122207 1006 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 1700003M07Rik-201ENSMUST00000139884 541 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm7577-201ENSMUST00000182543 982 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45824-201ENSMUST00000212236 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC140462.1-201ENSMUST00000225776 853 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm6187-201ENSMUST00000040649 960 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1333-201ENSMUST00000076019 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm5065-201ENSMUST00000056639 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm26874-201ENSMUST00000181959 1817 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dynlt3-201ENSMUST00000033519 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm38272-201ENSMUST00000194431 2400 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ptchd1-201ENSMUST00000038665 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Eps15l1-205ENSMUST00000212590 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr214-205ENSMUST00000217313 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tfpi-206ENSMUST00000111718 2027 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Plekha8-201ENSMUST00000101385 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37821-201ENSMUST00000195476 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Nlrp14-202ENSMUST00000142623 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 BC018473-201ENSMUST00000132056 1331 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dnm3-203ENSMUST00000159763 1305 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms