Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 n-R5s119-201ENSMUST00000178861 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 n-R5s127-201ENSMUST00000179185 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 n-R5s129-201ENSMUST00000180122 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 n-R5s131-201ENSMUST00000180280 119 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Ms4a3-202ENSMUST00000186023 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm45877-201ENSMUST00000212110 564 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC153974.1-201ENSMUST00000219012 430 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm10036-201ENSMUST00000079733 537 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Dbt-201ENSMUST00000000349 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC147250.1-201ENSMUST00000224781 1364 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Sdr16c5-201ENSMUST00000040925 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 S100a16-204ENSMUST00000107333 608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 4930417H01Rik-201ENSMUST00000123403 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Nip7-202ENSMUST00000170962 606 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Klrb1b-202ENSMUST00000172887 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Krtap14-202ENSMUST00000189774 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Rpl36-ps3-201ENSMUST00000085720 315 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Dixdc1-206ENSMUST00000120622 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Hps1O08983 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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