Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm4149-201ENSMUST00000099371 276 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cd300ld-201ENSMUST00000045075 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Trpv2-202ENSMUST00000102643 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gas8-203ENSMUST00000212923 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gria2-202ENSMUST00000107745 4026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm44987-201ENSMUST00000206578 750 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ednrb-201ENSMUST00000022718 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 St6gal1-206ENSMUST00000178797 4177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Akap8-201ENSMUST00000002699 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Acad12-201ENSMUST00000041252 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Ebpl-201ENSMUST00000022494 10092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp9yF8VPU6 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms