Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atg3Q9CPX6 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms