Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm10472-201ENSMUST00000193014 2102 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim35Q8C006 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Trim35Q8C006 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
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Trim35Q8C006 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Zcchc12-203ENSMUST00000115257 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trim35Q8C006 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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