Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nphp4P59240 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Vmn2r-ps81-201ENSMUST00000172519 838 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm26902-201ENSMUST00000181307 3100 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Rfxank-201ENSMUST00000075724 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Nphp4P59240 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms