Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cux1P53564 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gfpt2-201ENSMUST00000020629 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cux1P53564 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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Cux1P53564 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Cux1P53564 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Cux1P53564 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cux1P53564 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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