Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm21013-201ENSMUST00000184952 1201 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Yipf7-201ENSMUST00000031045 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Casp8-202ENSMUST00000165549 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxc5P32043 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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