Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm26911-203ENSMUST00000204781 369 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
RxraP28700 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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