Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23835-201ENSMUST00000104439 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ms4a3-201ENSMUST00000112984 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Timp1-202ENSMUST00000115342 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13879-201ENSMUST00000118308 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13198-201ENSMUST00000119322 826 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Scamp1-204ENSMUST00000153558 1255 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm22461-201ENSMUST00000175272 70 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm27913-201ENSMUST00000184473 173 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2610105M22Rik-201ENSMUST00000193707 1153 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37643-201ENSMUST00000195369 1260 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm10046-202ENSMUST00000208942 126 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC183268.3-201ENSMUST00000215015 282 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ccr6-206ENSMUST00000180103 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms