Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Aamdc-214ENSMUST00000178078 723 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC116596.2-201ENSMUST00000226642 526 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm20501-202ENSMUST00000211303 2194 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms