Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Homer1Q9Z2Y3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms