Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mbd3Q9Z2D8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mbd3Q9Z2D8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms