Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mtmr1Q9Z2C4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mtmr1Q9Z2C4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms