Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clic1Q9Z1Q5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clic1Q9Z1Q5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms