Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cog1Q9Z160 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cog1Q9Z160 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms