Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cpne6Q9Z140 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms