Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Xpr1Q9Z0U0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms