Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pmfbp1Q9WVQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pmfbp1Q9WVQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms