Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp46a1Q9WVK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp46a1Q9WVK8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms