Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tusc2Q9WVF8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tusc2Q9WVF8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms