Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VapaQ9WV55 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapaQ9WV55 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms