Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhx9Q9WUH2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lhx9Q9WUH2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms